Применение линейного дискриминантного анализа для классификации цианобактерий по спектрам собственной флуоресценции
На основе применения специальных методов математической статистики разработана методика классификации различных родов цианобактерий по спектрам собственной флуоресценции отдельных клеток in vivo. Проведен анализ нескольких сотен спектров, полученных средствами конфокальной лазерной сканирующей микроскопии для 20 различных штаммов цианобактерий, и разработана определенная процедура обработки исходных данных, а также порядок определения параметров, отражающих как общую форму спектров, так и соотношение отдельных пиков. Статистическими методами определен ряд ключевых параметров, достаточных для проведения процедуры классификации. Для решения задачи классификации применен стандартный многомерный дискриминантный анализ. Результаты работы предложенного алгоритма классификации продемонстрированы на примере дифференциации трех штаммов, принадлежащих к двум родам цианобактерий.
Авторы: Т. Р. Жангиров, А. С. Перков, А. А. Лисс, Н. Ю. Григорьева, Л. В. Чистякова
Направление: Информатика и компьютерные технологии
Ключевые слова: Цианобактерии, дискриминантный анализ, статистические методы в биологии, спектры флуоресценции
Открыть полный текст статьи